数据文件、Replication(备份、拷贝)相关文件、其他文件
（一）数据文件
在MySQL中每一个数据库都会在定义好（或者默认）的数据目录下存在一个以数据库名字命名的文件夹，用来存放该数据库中各种表数据文件。不同的MySQL存储引擎有各自不同的数据文件，存放位置也有区别。多数存储引擎的数据文件都存放在和MyISAM数据文件位置相同的目录下，但是每个数据文件的扩展名却各不一样。如MyISAM用“.MYD”作为扩展名，Innodb用“.ibd”，Archive用“.arc”，CSV用“.csv”，等等。
1、“.frm”文件
与表相关的元数据（meta）信息都存放在“.frm”文件中，包括表结构的定义信息等。不论是什么存储引擎，每一个表都会有一个以表名命名的“.frm”文件。所有的“.frm”文件都存放在所属数据库的文件夹下面。
2、“.MYD”文件
“.MYD”文件是MyISAM存储引擎专用，存放MyISAM表的数据。每一个MyISAM表都会有一个“.MYD”文件与之对应，同样存放于所属数据库的文件夹下，和“.frm”文件在一起。
3、“.MYI”文件
“.MYI”文件也是专属于MyISAM存储引擎的，主要存放MyISAM表的索引相关信息。对于MyISAM存储来说，可以被cache的内容主要就是来源于“.MYI”文件中。每一个MyISAM表对应一个“.MYI”文件，存放于位置和“.frm”以及“.MYD”一样。
4、“.ibd”文件和ibdata文件
这两种文件都是存放Innodb数据的文件，之所以有两种文件来存放Innodb的数据（包括索引），是因为Innodb的数据存储方式能够通过配置来决定是使用共享表空间存放存储数据，还是独享表空间存放存储数据。独享表空间存储方式使用“.ibd”文件来存放数据，且每个表一个“.ibd”文件，文件存放在和MyISAM数据相同的位置。如果选用共享存储表空间来存放数据，则会使用ibdata文件来存放，所有表共同使用一个（或者多个，可自行配置）ibdata文件。ibdata文件可以通过innodb_data_home_dir和innodb_data_file_path两个参数共同配置组成，innodb_data_home_dir配置数据存放的总目录，而innodb_data_file_path配置每一个文件的名称。当然，也可以不配置innodb_data_home_dir而直接在innodb_data_file_path参数配置的时候使用绝对路径来完成配置。innodb_data_file_path中可以一次配置多个ibdata文件。文件可以是指定大小，也可以是自动扩展的，但是Innodb限制了仅仅只有最后一个ibdata文件能够配置成自动扩展类型。当我们需要添加新的ibdata文件的时候，只能添加在innodb_data_file_path配置的最后，而且必须重启MySQL才能完成ibdata的添加工作。不过如果我们使用独享表空间存储方式的话，就不会有这样的问题，但是如果要使用裸设备的话，每个表一个裸设备，可能造成裸设备数量非常大，而且不太容易控制大小，实现比较困难，而共享表空间却不会有这个问题，容易控制裸设备数量。我个人还是更倾向于使用独享表空间存储方式。当然，两种方式各有利弊，看大家各自应用环境的侧重点在那里了。
上面仅仅介绍了两种最常用存储引擎的数据文件，此外其他各种存储引擎都有各自的数据文件，读者朋友可以自行创建某个存储引擎的表做一个简单的测试，做更多的了解。
Replication(备份、拷贝)相关文件（主从数据库）
1、master.info文件：
master.info文件存在于Slave端的数据目录下，里面存放了该Slave的Master端的相关信息，包括Master的主机地址，连接用户，连接密码，连接端口，当前日志位置，已经读取到的日志位置等信息。
2、relaylog和relaylogindex(转发日志)
mysql-relay-bin.xxxxxn文件用于存放Slave端的I/O线程从Master端所读取到的BinaryLog信息，然后由Slave端的SQL线程从该relaylog中读取并解析相应的日志信息，转化成Master所执行的SQL语句，然后在Slave端应用。
mysql-relay-bin.index文件的功能类似于mysql-bin.index，同样是记录日志的存放位置的绝对路径，只不过他所记录的不是BinaryLog，而是RelayLog。
3、relay-log.info文件：
类似于master.info，它存放通过Slave的I/O线程写入到本地的relaylog的相关信息。供Slave端的SQL线程以及某些管理操作随时能够获取当前复制的相关信息。
其他文件：
1、systemconfigfile
MySQL的系统配置文件一般都是“my.cnf”，Unix/Linux下默认存放在"/etc"目录下，Windows环境一般存放在“c:/windows”目录下面。“my.cnf”文件中包含多种参数选项组（group），每一种参数组都通过中括号给定了固定的组名，如“[mysqld]”组中包括了mysqld服务启动时候的初始化参数，“[client]”组中包含着客户端工具程序可以读取的参数，此外还有其他针对于各个客户端软件的特定参数组，如mysql程序使用的“[mysql]”，mysqlchk使用的“[mysqlchk]”，等等。用户可以自定义参数，也可以自己设定一个参数组名，将相关参数配置在里面，然后调用mysql客户端api程序中的参数读取api读取相关参数。
2、pidfile
pidfile是mysqld应用程序在Unix/Linux环境下的一个进程文件，和许多其他Unix/Linux服务端程序一样，存放着自己的进程id。
3、socketfile
socket文件也是在Unix/Linux环境下才有的，用户在Unix/Linux环境下客户端连接可以不通过TCP/IP网络而直接使用UnixSocket来连接MySQL。